MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis NCPPB 382 chromosome

Total Repeats: 95135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009480	CCGAC	2	10	14	23	20 %	0 %	20 %	60 %	148271179
2	NC_009480	CGC	2	6	48	53	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271179
3	NC_009480	TCA	2	6	95	100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271179
4	NC_009480	TGG	2	6	104	109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271179
5	NC_009480	AGC	2	6	179	184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271179
6	NC_009480	GCTC	2	8	215	222	0 %	25 %	25 %	50 %	148271179
7	NC_009480	GCC	2	6	229	234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271179
8	NC_009480	GCCG	2	8	303	310	0 %	0 %	50 %	50 %	148271179
9	NC_009480	AGC	2	6	314	319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271179
10	NC_009480	CTGC	2	8	367	374	0 %	25 %	25 %	50 %	148271179
11	NC_009480	CGG	2	6	435	440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271179
12	NC_009480	GTCGCC	2	12	469	480	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148271179
13	NC_009480	CT	3	6	506	511	0 %	50 %	0 %	50 %	148271179
14	NC_009480	CTG	2	6	547	552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271179
15	NC_009480	GGA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271179
16	NC_009480	TCA	2	6	635	640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271179
17	NC_009480	AAC	2	6	652	657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271179
18	NC_009480	CTG	2	6	700	705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271179
19	NC_009480	CGA	2	6	708	713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271179
20	NC_009480	TCC	2	6	722	727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271179
21	NC_009480	AGG	2	6	746	751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271179
22	NC_009480	CTT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271179
23	NC_009480	CAA	2	6	786	791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271179
24	NC_009480	GTC	2	6	796	801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271179
25	NC_009480	GCC	2	6	816	821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271179
26	NC_009480	TCA	2	6	875	880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271179
27	NC_009480	TCC	2	6	920	925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271179
28	NC_009480	GAA	2	6	927	932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271179
29	NC_009480	GAC	2	6	961	966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271179
30	NC_009480	CCA	2	6	983	988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271179
31	NC_009480	CAA	2	6	1053	1058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271179
32	NC_009480	CAT	2	6	1143	1148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271179
33	NC_009480	CGA	2	6	1182	1187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271179
34	NC_009480	ACCAC	2	10	1307	1316	40 %	0 %	0 %	60 %	148271179
35	NC_009480	CAA	2	6	1329	1334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271179
36	NC_009480	ACC	2	6	1412	1417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271179
37	NC_009480	GGAC	2	8	2094	2101	25 %	0 %	50 %	25 %	148271180
38	NC_009480	GTC	2	6	2109	2114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271180
39	NC_009480	CCGC	2	8	2132	2139	0 %	0 %	25 %	75 %	148271180
40	NC_009480	GAG	2	6	2161	2166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271180
41	NC_009480	GCC	2	6	2189	2194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271180
42	NC_009480	CAC	2	6	2241	2246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271180
43	NC_009480	GCT	2	6	2292	2297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271180
44	NC_009480	GAG	2	6	2311	2316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271180
45	NC_009480	CCT	2	6	2352	2357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271180
46	NC_009480	GCCG	2	8	2358	2365	0 %	0 %	50 %	50 %	148271180
47	NC_009480	CGC	2	6	2373	2378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271180
48	NC_009480	GAC	2	6	2413	2418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271180
49	NC_009480	TCA	2	6	2429	2434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271180
50	NC_009480	CGG	2	6	2523	2528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271180
51	NC_009480	CGAC	2	8	2537	2544	25 %	0 %	25 %	50 %	148271180
52	NC_009480	GCCC	2	8	2568	2575	0 %	0 %	25 %	75 %	148271180
53	NC_009480	CGA	2	6	2643	2648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271180
54	NC_009480	GCT	2	6	2694	2699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271180
55	NC_009480	CCG	2	6	2716	2721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271180
56	NC_009480	TCA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271180
57	NC_009480	CGC	2	6	2794	2799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271180
58	NC_009480	GGC	2	6	2823	2828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271180
59	NC_009480	CCT	2	6	2913	2918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271180
60	NC_009480	GTG	2	6	2935	2940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271180
61	NC_009480	CTG	2	6	2959	2964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271180
62	NC_009480	CAA	2	6	3027	3032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148271180
63	NC_009480	TCC	2	6	3061	3066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271180
64	NC_009480	CTG	2	6	3100	3105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271180
65	NC_009480	CTG	3	9	3115	3123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271180
66	NC_009480	TCG	2	6	3163	3168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271181
67	NC_009480	GC	5	10	3194	3203	0 %	0 %	50 %	50 %	148271181
68	NC_009480	CGA	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271181
69	NC_009480	CGC	3	9	3281	3289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271181
70	NC_009480	GGCA	2	8	3326	3333	25 %	0 %	50 %	25 %	148271181
71	NC_009480	CGT	2	6	3347	3352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271181
72	NC_009480	CG	3	6	3362	3367	0 %	0 %	50 %	50 %	148271181
73	NC_009480	CGG	2	6	3398	3403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271181
74	NC_009480	CGA	2	6	3419	3424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271181
75	NC_009480	TCG	2	6	3466	3471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271181
76	NC_009480	GCG	2	6	3487	3492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271181
77	NC_009480	CGG	2	6	3527	3532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271181
78	NC_009480	GAG	2	6	3597	3602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271181
79	NC_009480	ATG	2	6	3675	3680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271181
80	NC_009480	CTC	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271181
81	NC_009480	CAT	2	6	3725	3730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271181
82	NC_009480	GTC	2	6	3774	3779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271181
83	NC_009480	GCT	2	6	3788	3793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271181
84	NC_009480	AGG	2	6	3817	3822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271181
85	NC_009480	GAG	2	6	3885	3890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271181
86	NC_009480	CG	3	6	3938	3943	0 %	0 %	50 %	50 %	148271181
87	NC_009480	TCC	2	6	3948	3953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271181
88	NC_009480	AGG	2	6	3958	3963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271181
89	NC_009480	CGG	2	6	4007	4012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271181
90	NC_009480	AGA	2	6	4024	4029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271181
91	NC_009480	ACC	2	6	4037	4042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271181
92	NC_009480	GAT	2	6	4044	4049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271182
93	NC_009480	CGTC	2	8	4050	4057	0 %	25 %	25 %	50 %	148271182
94	NC_009480	CG	3	6	4090	4095	0 %	0 %	50 %	50 %	148271182
95	NC_009480	GGGCA	2	10	4141	4150	20 %	0 %	60 %	20 %	148271182
96	NC_009480	TGG	2	6	4160	4165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271182
97	NC_009480	CCG	2	6	4244	4249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271182
98	NC_009480	CG	3	6	4255	4260	0 %	0 %	50 %	50 %	148271182
99	NC_009480	CTG	2	6	4261	4266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271182
100	NC_009480	CG	3	6	4324	4329	0 %	0 %	50 %	50 %	148271182
101	NC_009480	CG	3	6	4355	4360	0 %	0 %	50 %	50 %	148271182
102	NC_009480	GGA	2	6	4398	4403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271182
103	NC_009480	GCT	2	6	4443	4448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271182
104	NC_009480	GCT	2	6	4455	4460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271182
105	NC_009480	TGC	2	6	4463	4468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271182
106	NC_009480	CGC	2	6	4472	4477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271182
107	NC_009480	AGC	2	6	4517	4522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271182
108	NC_009480	CTG	2	6	4531	4536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271182
109	NC_009480	GGCGCG	2	12	4542	4553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271182
110	NC_009480	GATCG	2	10	4611	4620	20 %	20 %	40 %	20 %	148271182
111	NC_009480	ATC	2	6	4624	4629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271182
112	NC_009480	GC	3	6	4633	4638	0 %	0 %	50 %	50 %	148271182
113	NC_009480	CG	5	10	4671	4680	0 %	0 %	50 %	50 %	148271182
114	NC_009480	TGGCGG	2	12	4685	4696	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	148271182
115	NC_009480	CG	3	6	4716	4721	0 %	0 %	50 %	50 %	148271182
116	NC_009480	GAC	2	6	4744	4749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271182
117	NC_009480	GAC	2	6	4759	4764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271182
118	NC_009480	GC	3	6	4783	4788	0 %	0 %	50 %	50 %	148271182
119	NC_009480	CGG	2	6	4791	4796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271182
120	NC_009480	CG	3	6	4845	4850	0 %	0 %	50 %	50 %	148271182
121	NC_009480	CGA	2	6	4902	4907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271182
122	NC_009480	GCT	2	6	5004	5009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271182
123	NC_009480	GCGAC	2	10	5010	5019	20 %	0 %	40 %	40 %	148271182
124	NC_009480	CGA	2	6	5049	5054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271182
125	NC_009480	CAGGC	2	10	5074	5083	20 %	0 %	40 %	40 %	148271182
126	NC_009480	GGC	2	6	5166	5171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271182
127	NC_009480	GCCT	2	8	5217	5224	0 %	25 %	25 %	50 %	148271182
128	NC_009480	GCG	2	6	5251	5256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271182
129	NC_009480	CG	3	6	5265	5270	0 %	0 %	50 %	50 %	148271183
130	NC_009480	CGG	2	6	5276	5281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271183
131	NC_009480	CCG	2	6	5315	5320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271183
132	NC_009480	CGTC	2	8	5344	5351	0 %	25 %	25 %	50 %	148271183
133	NC_009480	GAC	2	6	5510	5515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271183
134	NC_009480	GAG	2	6	5526	5531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271183
135	NC_009480	TCG	2	6	5544	5549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271183
136	NC_009480	CCT	2	6	5570	5575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271183
137	NC_009480	ACG	2	6	5637	5642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271183
138	NC_009480	CG	3	6	5749	5754	0 %	0 %	50 %	50 %	148271183
139	NC_009480	CA	3	6	5972	5977	50 %	0 %	0 %	50 %	148271184
140	NC_009480	CGA	2	6	5987	5992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271184
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142	NC_009480	GAG	2	6	6018	6023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271184
143	NC_009480	CAG	2	6	6054	6059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271184
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149	NC_009480	CGT	2	6	6266	6271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271184
150	NC_009480	CGA	2	6	6272	6277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271184
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153	NC_009480	CGG	2	6	6392	6397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271184
154	NC_009480	CGT	2	6	6419	6424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271184
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156	NC_009480	CG	4	8	6615	6622	0 %	0 %	50 %	50 %	148271184
157	NC_009480	CAG	2	6	6627	6632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271184
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159	NC_009480	ACG	2	6	6670	6675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271184
160	NC_009480	GCACC	2	10	6698	6707	20 %	0 %	20 %	60 %	148271184
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163	NC_009480	GTC	2	6	6777	6782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271184
164	NC_009480	AAG	2	6	6822	6827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271184
165	NC_009480	ACC	2	6	6855	6860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271184
166	NC_009480	GCAC	2	8	6916	6923	25 %	0 %	25 %	50 %	148271184
167	NC_009480	GAG	2	6	6924	6929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271184
168	NC_009480	CG	3	6	6936	6941	0 %	0 %	50 %	50 %	148271184
169	NC_009480	CAC	2	6	6947	6952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271184
170	NC_009480	CG	4	8	6968	6975	0 %	0 %	50 %	50 %	148271184
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174	NC_009480	TCG	2	6	7135	7140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271184
175	NC_009480	CAG	2	6	7143	7148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271184
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224	NC_009480	CTC	2	6	8890	8895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271185
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242	NC_009480	TGA	2	6	9494	9499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271185
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249	NC_009480	AGC	2	6	9608	9613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271185
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253	NC_009480	GAG	3	9	9772	9780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271185
254	NC_009480	TGG	2	6	9782	9787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148271185
255	NC_009480	CG	3	6	9797	9802	0 %	0 %	50 %	50 %	148271185
256	NC_009480	CAGC	2	8	9840	9847	25 %	0 %	25 %	50 %	148271185
257	NC_009480	GGC	2	6	9853	9858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271185
258	NC_009480	CGA	2	6	9888	9893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271185
259	NC_009480	CTT	2	6	9906	9911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148271185
260	NC_009480	CAC	3	9	9915	9923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148271185
261	NC_009480	GCT	2	6	9933	9938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271185
262	NC_009480	AGG	2	6	9989	9994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271185
263	NC_009480	GAG	2	6	10051	10056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148271185
264	NC_009480	CAG	2	6	10060	10065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148271185
265	NC_009480	TGA	2	6	10127	10132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148271185
266	NC_009480	AGA	2	6	10133	10138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148271185
267	NC_009480	CGG	2	6	10170	10175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148271185
268	NC_009480	CAT	2	6	10176	10181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271185
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271	NC_009480	CTC	2	6	10249	10254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271185
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280	NC_009480	GC	3	6	10526	10531	0 %	0 %	50 %	50 %	148271185
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381	NC_009480	ACCCG	2	10	14750	14759	20 %	0 %	20 %	60 %	148271191
382	NC_009480	GCC	2	6	14760	14765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148271191
383	NC_009480	TCA	2	6	14791	14796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148271191
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498	NC_009480	CTC	2	6	18980	18985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271194
499	NC_009480	CTC	2	6	18989	18994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148271194
500	NC_009480	GTC	2	6	18995	19000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148271194

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